一、访问链接

http://pfam.xfam.org/

二、资源介绍

Pfam（the protein family database, MSA）收集了大量使用多重序列比对和隐马尔可夫模型（hidden markov models, HMMs）对UniProKB的蛋白质序列数据进行结构域归类形成的蛋白质家族，广泛用于通过序列比对推测蛋白质的结构域排布形式及功能。Pfam包括高质量、手工确定的Pfam-A，和利用ADDA算法自动分类的低质量、未注释的Pfam-B数据库。该数据库可使用蛋白质或DNA序列搜索蛋白质所属家族，查看该家族的功能注释和多序列比对，扩展至属于同一群落（clan）的多个家族，查看一个目标序列的结构域组成，连接到该序列旨在PDB数据库中的结果，或直接使用关键字检索。